Качественный анализ мутаций, делеций, инсерций в гене CALR

Подготовка к исследованию

Специальной подготовки не требуется.

Описание

Ген кальретикулина CALR расположен на р плече 19-й хромосомы. Ген кодирует многофункциональный белок кальретикулин, регулирующий гомеостаз ионов кальция. Наличие мутации в гене CALR ведет к активации моноцитов, способствуя выработке провоспалительных цитокинов, многие из которых участвуют в регуляции передачи сигнала по JAK/STAT пути. Активация сигнального пути JAK/STAT занимает центральное место в развитии миелопролиферативных заболеваний.
Патогенез миелопролиферативных заболеваний при мутациях в гене CALR до конца не изучен. Ведущей является гипотеза, согласно которой мутантный белок CALR взаимодействует с рецептором тромбопоэтина и индуцирует его структурные изменения, достаточные для активации JAK2, задействованной в процессах передачи сигнала для выживания и пролиферации гемопоэтических клеток. Этот процесс оказывается возможным благодаря смене отрицательного заряда С-домена белка CALR на положительный в результате делеций и инсерций в 9-м экзоне гена CALR.
Структурно белок CALR представлен тремя доменами: N, P и С. N-домен способен связываться с рецептором тромбопоэтина. В неизмененном белке этому противодействует домен Р. Мутантный С-конец блокирует Р-домен, освобождая N-домен и делая возможным его конкурентное связывание с рецептором. Таким образом, активация путей передачи сигнала в клетке осуществляется независимо от уровня тромбопоэтина.
Наиболее частые варианты (88% всех встречающихся) мутаций в гене CALR подразделяют на 2 типа: 1 тип -- это делеции, т.е. потери части нуклеотидной последовательности; 2 тип-- инсерции (вставки).
Мутации в гене CALR обнаруживаются у 20% пациентов с эссенциальной (первичной) тромбоцитемией (ЭТ) и у 25% пациентов с первичным миелофиброзом (ПМ).
При истинной полицитемии дефекты гена CALR не характерны.
Мутации в гене CALR ассоциированы с молодым возрастом пациентов, высоким уровнем тромбоцитов и благоприятным прогнозом течения. При ЭТ значимых различий в выживаемости больных с делециями и инсерциями не выявлено, при ПМ наиболее длительная выживаемость отмечена у CALR-положительных пациентов с инсерциями.

Показания к назначению

• Диагностика миелопролиферативных заболеваний: эссенциальной тромбоцитемии (ЭТ) и первичного миелофиброза (ПМ) при отрицательном результате тестирования на мутацию V617F в гене JAK2

Интерферирующие факторы

—

Причины отклонения показателей от нормы (повышенные значения)

Мутация CALR обнаружена.

Причины отклонения показателей от нормы (сниженные значения)

Мутация CALR не обнаружена.

Метод:

ПЦР с детекцией в режиме реального времени; Диагностическое секвенирование;

Анализатор:

Генетический анализатор Applied Biosystems 3500/3500xl, Thermo Fisher Scientific, США;